Outil de diagnostic in vitro pour les échantillons métagénomiques complexes
Capture de Séquences génomiques par hybridation
Solution Technologique
Dans l’application biomédicale, les agents pathogènes microbiens sont une préoccupation de santé publique. Les génomes des agents pathogènes sont généralement très petits par rapport à ceux de leur hôte humain. Les méthodes existantes de lutte contre la contamination d’échantillons biologiques par de l’ADN infectieux dans les échantillons sont relativement coûteuses et nécessitent beaucoup de temps, et / ou une manipulation spécifique des échantillons.
La technologie consiste à :
- un enrichissement de séquences d’ADN pathogène dans des échantillons complexes basés sur la capture d’hybridation d’acides nucléiques en solution
- une amélioration de l’effort de séquençage, spécificité et sensibilité du diagnostic.
Avantages offerts
- Capture de gros fragments d’acide nucléique (min 6 000 pb)
- Capture d’environnements génétiques inconnus et de nouvelles combinaisons de gènes
- Ensemble de sondes Oligo nucléotidiques d’origine
- Reconstruction facilitée de grandes régions (opérons, plasmides…)
- Accès à des génomes rares
- Sensibilité / spécificité accrue de l’exploration d’échantillons métagénomiques
- Amélioration de l’effort de séquençage sur des échantillons métagénomiques.
Etat d’avancement
- POC sur des échantillons de patients atteints de maladies pulmonaires
- Méthode plus efficace que le système d’enrichissement de cible SureSelectXT® d’Agilent Technologies.
Opportunités commerciales
- Diagnostic in vitro pour application biomédicale
- Application multi-espèces
- Applications environnementales et végétales possibles.
UFR de Médecine et des Professions Paramédicales Clermont Auvergne Innovation
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